水稻機插秧苗標準因季節不同而不同，南方和北方的單季稻也存在差異。單季稻機插秧所使用的是以營養土為載體的標準化秧苗，要求秧苗根系發達、苗高適宜、莖部粗壯、葉挺色綠、均勻整齊。南方單季稻機插秧秧苗一般秧齡15～20天，葉齡3～4葉，適宜苗高12～18厘米，秧盤秧苗均勻整齊，根系發達，根系盤結，且秧塊提起不散，葉色淡綠色，葉片挺立。秧苗太小時機插質量受到影響，太高則機插時傷秧嚴重，機插搭苗現象也較重，影響秧苗返青。

連作早稻育秧期間氣溫低，秧苗生長緩慢，一般要求秧齡30天左右，葉齡3.5～4.5葉，苗高12～20厘米，秧盤秧苗均勻整齊，根系發達，根系盤結，且秧塊提起不散，葉色淡綠色，葉片挺立。

連作晚稻由于育秧期間氣溫高，秧苗生長快，秧苗株高可適當放寬，連作晚稻機插秧苗的秧齡一般在12～20天，苗高12～22厘米，秧盤秧苗均勻整齊，根系發達，根系盤結，且秧塊提起不散，葉色淡綠色，葉片挺立。不能超過25厘米，以免機插時傷秧嚴重或普通插秧機無法機插。

我國機插秧秧秧盤大多為9村秧盤，秧塊的標準尺寸為58厘米×28厘米，這樣的秧塊整體放入秧箱內，才不會卡滯或脫空造成漏插。秧塊的厚度一般為2.0～2.5厘米，鋪土時通過機械或人工來控制。秧塊過薄或過厚會造成秧爪傷秧過多或取秧不勻。因此，在育秧過程中尤其要做好秧苗的病蟲害管理，確保秧塊內秧苗青秀無病，盡可能不帶病株入田。